حوزه علمیه حضرت سید الشهدا علیه السلام از مراکز مرتبط با مرجعیت در کربلای معلی، در ایام زیارت میلیونی اربعین مقدس حسینی ۱۴۴۵ میزبان هزاران زائر حسینی است.
این حوزه علمیه که در خیابان باب القبله حرم مطهر امام حسین علیه السلام واقع شده است، در عمل به تأکیدات و ارشادات مرجع عالیقدر آیت الله العظمی سید صادق حسینی شیرازی دام ظله درخصوص تکریم زائران اربعین حسینی، ضمن آماده سازی فضایی برای اسکان زائران، به صورت روزانه از صدها زائر حسینی میزبانی می کند.